按《云南省重点实验室管理办法》（云南省科学技术厅公告第5号）要求， 2013年12月27日上午，学校科技处在我校科学馆组织召开了“云南大学2013年度省重点实验室的年度考核评估会议”，会议邀请科技厅基础处毕红处长参会指导工作，科技处处长杨宇教授主持会议。考核评估小组由以云南农业大学原校长陈海如教授为组长的校内外5名专家共同组成，针对2013年度各省重点实验室在科研成果、队伍建设与人才培养、开放交流与运行管理等方面的工作业绩进行考核评估。
专家组依据各重点实验室汇报交流质询情况，参照科技厅基础处拟定的“云南省重点实验室评估意见表”，对各重点实验室进行了定性定量评价。目前，我校共有4个省重点实验室，均参加了本次省重点实验室的考核评估会议。各重点实验室得分依次为云南省工业微生物发酵工程重点实验室93.8分、云南省古生物研究重点实验室89分、云南省软件工程重点实验室88.2分、云南省国际河流与跨境生态安全重点实验室83.8分。专家组一致认为我校省重点实验室总体上运行情况良好，但个别实验室在建设管理方面有待加强。
云南省工业微生物发酵工程重点实验室，目前承担了国家973计划“农作物重要病原线虫生物防控的基础研究”项目，项目首席科学家为实验室主任张克勤教授。在国家重大项目的支撑下，无论是项目、文章、专利还是为社会经济转化服务方面，实验室都取得了比以往更为丰硕的成果。2013年新上各类项目24项，其中国家级项目19项；发表论文98篇，其中SCI论文90篇，影响因子3以上21篇，影响因子4以上9篇，影响因子9以上2篇；获国家发明专利授权8项，新申请专利10项；获各类奖项5项，云南省自然科学一等奖1项、三等奖1项，云南省科技进步二等奖2项、三等奖1项。值得一提的是，实验室采取了压缩文章数量提高文章质量的有效措施并取得了突出成绩，部分论文发表在PLoS Pathogens、Biotechnology Advances、Environmental Microbiology等具有重大影响力的著名杂志上。据2013年ESI（Essential Science Indicators）权威数据库公布，我校微生物学科和化学学科是我省高校众多学科中率先进入全球机构前1%的两个学科。
云南省古生物研究重点实验室，在多年对澄江动物群研究、磷酸盐化石群研究等的学术积累上产出了令人瞩目的科研成果，2013年共发表文章10篇（SCI论文9篇），其中有2篇论文发表在国际顶级学术刊物Nature上。2013年实验室新获准国家基金项目2个（含1个联合基金项目）、国家重点实验室开放基金项目1个，合同经费330万元。尽管研究方向独树一帜，实验室仍力所能及扩大对外服务社会的功能。4月禄丰工作站的成立，一方面为实验室进一步研究中生代动植物化石提供重要科研平台，为扩大禄丰化石的国际影响力做出积极推动作用，另一方面将加大我省与化石相关的旅游资源的挖掘利用，积极推动地方经济建设。5月，实验室邀请Derek James Siveter、David John Siveter等4位国际知名古生物学家来访，就澄江生物群自然遗产遗址未来的保护开发建言献策，为澄江化石地在列为世界自然遗产遗址之后的保护和发展贡献一份绵薄之力。
云南省软件工程重点实验室， 2013年新获国家自然科学基金项目5项、省部级项目2项、其他项目4项，合同经费649万元；获国家软件著作权2项，科技成果转化项目1项，产生直接经济效益30万元；发表论文42篇，其中SCI/EI论文26篇，部分论文发表在IEEE Transactions on Computers、Advanced Science Letters、Journal of Software等重要期刊上；在清华大学出版社出版译著1部。实验室全面实行对外开放与合作，自实验室成立，就设立了开放基金，目前共有44个开放基金项目在研，项目经费达到345万元。实验室广泛实施与国际知名企业、大学的合作，2013年继续推进与微软、IBM、微软、思科、SAP等跨国公司的合作与交流，11月特聘梅宏院士为实验室名誉主任。目前，云南省软件工程重点实验室正按照云南省人民政府的安排，主持承担我省与微软公司小语种软件研发、小语种软件研发基地、微软IT学院的建设任务。
云南省国际河流与跨境生态安全重点实验室，2013年新增国家级、省部级项目20项（含1项国家科技支撑计划重大项目，国家自然科学基金10项），除了上述国家部委和省级科研项目以外，实验室还承担了2项国际合作研究项目，以及数十项地方政府、企事业单位等委托的相关科研项目；共发表论文40篇，其中SCI/EI论文24篇，部分论文发表在Fish and Fisheries、Renewable and Sustainable Energy Reviews、Journal of climate、Plos One等相关领域的国际权威期刊上。出版专著2部、参编专著2部。提交高层决策咨询报告3份，为相关企业提供专题咨询报告4份。申请发明专利1项、批准发明专利1项。2013年，实验室在澜沧江支流基独河和元江干流老寨建立了两个定位观测基地，为今后的科研工作奠定了坚实的基础。此外，与清华大学共同组织开展国际合作项目“Knowledge Exchange on International Waters (KEIW)”（英国国际发展部-DFID资助），2013年组织了2次大型培训和1次国际考察，参加培训人员来自亚洲11国共计超过80人，进一步扩大了实验室在国际河流与生态安全领域研究的影响力。
我校历来重视云南省重点实验室及其他各类条件平台的建设管理工作，云南省重点实验室年度考核评估会议的召开表明我校条件平台建设管理工作愈加规范。通过实施年度考核，专家组对各省重点实验室目前存在的问题以及后续运转提出了建设性的意见，将为实验室未来的发展规划具有重要指导意义。
